209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1689 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  687    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  32.38 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  26.19 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  26.34 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  43.69 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.61 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  46.25 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  43.37 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  47.22 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  45.21 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  40.74 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  36 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  41.56 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  23.94 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  37.23 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  44.93 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  42.47 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  43.24 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  37.23 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  39.74 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  36.14 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  30.71 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  31.01 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  27.91 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  41.1 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  45.71 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  43.06 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  39.74 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  45.83 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  45.83 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  24.12 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  41.67 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  41.43 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  39.13 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  40.58 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  34.34 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  40.51 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  41.67 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  30.71 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.65 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  32.1 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  32.1 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.1 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  24.54 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  44.26 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  23.12 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  28.91 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  37.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  32.17 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  35.06 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  41.18 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  36.11 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  32.1 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  32.1 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  32.1 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  32.1 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  32.1 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  41.18 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  35.62 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  42.86 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  35.06 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  31.09 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>