169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1009 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  44.19 
 
 		 267 aa  94.4  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 287 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  43.22 
 
 		 266 aa  91.3  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  38.57 
 
 		 248 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  39.85 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  39.32 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  26.7 
 
 		 312 aa  71.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  43.06 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  43.06 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  43.06 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.32 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  33.52 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  39.02 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  46.03 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  32.03 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  33.15 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  44.59 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  44.44 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  44.59 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  39.68 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  44.29 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  39.24 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  39.24 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  39.39 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  45.33 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  40.62 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  40.54 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  28.99 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  46.88 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  49.18 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  42.03 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  36.59 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.06 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 345 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 319 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  47.14 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  42.86 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  41.1 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  35.14 
 
 		 407 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  32.48 
 
 		 510 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.12 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  35.17 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 		 511 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  42.25 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  25.37 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  36.23 
 
 		 258 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.63 
 
 		 361 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 307 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.09 
 
 		 380 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.63 
 
 		 361 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  35.09 
 
 		 357 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.1 
 
 		 436 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  24.63 
 
 		 356 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  24.63 
 
 		 356 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  38.16 
 
 		 312 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  32.8 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  32.14 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  32.99 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  36.67 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  45.76 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  34.07 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.88 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  39.47 
 
 		 310 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  30.72 
 
 		 321 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  28.12 
 
 		 448 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  33.85 
 
 		 441 aa  48.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  23.88 
 
 		 374 aa  48.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  29.32 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>