203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1422 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  597  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  33.1 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.62 
 
 
258 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.93 
 
 
251 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 
281 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  28.47 
 
 
266 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 
249 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  27.62 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  25.93 
 
 
256 aa  92.4  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.5 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  28.48 
 
 
312 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.42 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  25.09 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  26.71 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  28.08 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  25.66 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.21 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  26.16 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  27.11 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  26.49 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  26.26 
 
 
245 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25.46 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  26.96 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  26.69 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  50.72 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  51.39 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.62 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  28.09 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  26.21 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.27 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  29.03 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  26.41 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.91 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  26.12 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  26.99 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  32.45 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  28.92 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  36.49 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  31.13 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  44.44 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  25.28 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.7 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  41.41 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  36.29 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  22.78 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  23.55 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  40 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.61 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  23.67 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  29.05 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  43.55 
 
 
441 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  24.48 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  28.71 
 
 
566 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  26.27 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  41.54 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  43.48 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  44.26 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  60.1  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  36.11 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  24.46 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
450 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  48 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  33.04 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  33.01 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
199 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  28.19 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  24.72 
 
 
406 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  25.53 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  33.04 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  44.29 
 
 
407 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  33.04 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  33.04 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  33.04 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  32.98 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  32.98 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  29.59 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  44.62 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  41.43 
 
 
404 aa  56.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  28.79 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  31.71 
 
 
374 aa  56.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>