122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0277 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  41.25 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  42.05 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  35.63 
 
 		 266 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  36.59 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  42.86 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  30.69 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  40.54 
 
 		 436 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  39.73 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  38.16 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  39.74 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  42.65 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  39.74 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  42.62 
 
 		 293 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  34.52 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  42.65 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  37.63 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  36.62 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  43.08 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 296 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.97 
 
 		 340 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 328 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  34.52 
 
 		 566 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  39.74 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  38.89 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  38.89 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.16 
 
 		 404 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 297 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 345 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  24.82 
 
 		 323 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  30 
 
 		 407 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 199 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 265 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35.29 
 
 		 284 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40.3 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 289 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  35.96 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 234 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  37.5 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  28.95 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  23.08 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  31.94 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.43 
 
 		 380 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.43 
 
 		 376 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.25 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.76 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  34.72 
 
 		 271 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30.53 
 
 		 375 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  36.62 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  31.82 
 
 		 340 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 301 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  33.8 
 
 		 266 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.9 
 
 		 338 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  35.82 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  36.23 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  34.72 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  28.75 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  36.11 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  31.17 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  26.37 
 
 		 448 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  27.71 
 
 		 307 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 		 511 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  28.99 
 
 		 441 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  44.62 
 
 		 313 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  32.86 
 
 		 314 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 351 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 307 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  28.99 
 
 		 331 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3239  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  34.78 
 
 		 280 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>