214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1621 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  32.68 
 
 
311 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  28.12 
 
 
323 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.6 
 
 
334 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  26.6 
 
 
334 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  26.28 
 
 
334 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  26.43 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.23 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.95 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  25.88 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  26.2 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  29.45 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  24.92 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  29.21 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  24.92 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  24.92 
 
 
337 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  26.05 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.38 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  38.84 
 
 
448 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  25.07 
 
 
356 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.67 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.48 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  24.08 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.16 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.16 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  26.24 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  24.51 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  28.05 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  28.12 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  25.82 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.1 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.93 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  24.21 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  26.32 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  26.32 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  24.43 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.64 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  27.5 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  25.37 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  25.84 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  24.08 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  21.39 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  27.99 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  23.38 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  24.92 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  25.5 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  40.82 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  23.03 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  23.34 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  22.89 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  27.46 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  25.71 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  26.33 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  29.73 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.83 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 
369 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.02 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.68 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.08 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.16 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  26.05 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.5 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  34.75 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  22.77 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  29.13 
 
 
130 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  23.33 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  32.2 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  28.24 
 
 
348 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.75 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  31.87 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  23.59 
 
 
288 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  37.8 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  46.38 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  40.91 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  29.57 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  23.86 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  38.96 
 
 
565 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  38.1 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>