184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0651 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  95.2 
 
 		 273 aa  518  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  51.14 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.28 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  24.6 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  22.89 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  40.51 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  38.82 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  22.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  27.16 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  43.06 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  40.58 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  22.76 
 
 		 325 aa  62  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  31.25 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  25.25 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.43 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  29.24 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  38.89 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  29.21 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  29.21 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  55.32 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  24.83 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  28.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  28.66 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  24.41 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  42.03 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  42.03 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  40.58 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  43.48 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  21.45 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  45 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  46.03 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  38.03 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  23.42 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 501 aa  55.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  44.44 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.58 
 
 		 566 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  44.44 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  44.44 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  44.44 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  44.44 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  44.44 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.86 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  24.48 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  30.14 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  35.23 
 
 		 378 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  36.17 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  36.9 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  29.1 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  36.23 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  39.06 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 334 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  34.95 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  26.51 
 
 		 398 aa  52.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.33 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  26.85 
 
 		 189 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  33.78 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  40.98 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  41.33 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  20.58 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.4 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 469 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  23.01 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  32.47 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.5 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.56 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>