201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0520 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  33.83 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  42.03 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  30.88 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  41.3 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  29.93 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  35.83 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  39.86 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  41.86 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  41.86 
 
 		 303 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  41.09 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  42.66 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  32.4 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  59.72 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.72 
 
 		 314 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  48.15 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  46.05 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  31.75 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  46.75 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.25 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  43.75 
 
 		 441 aa  79.3  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  44.29 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  44.29 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24.74 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  34.65 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.92 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.72 
 
 		 256 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.33 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  32.65 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 130 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 130 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  38.14 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  24.81 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  25.23 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  42.65 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  25.7 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  23.68 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  23.91 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  23.91 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  36.23 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  36.84 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  39.13 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  35.9 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  42.65 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  19.92 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  32.77 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  30.07 
 
 		 565 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  42.86 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  32.89 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  35.44 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  29.67 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  28.12 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  28.91 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  26.56 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  33.05 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  32.88 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  30.49 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.78 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  37.68 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  31.94 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  37.68 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  38.24 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  31.34 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  30.14 
 
 		 510 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.45 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  37.84 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.47 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1987  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  31.88 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  28.35 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  31.94 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>