121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1821 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  58.78 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  42.69 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  31.88 
 
 
295 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  34.6 
 
 
256 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  31.69 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  44.03 
 
 
248 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  44.03 
 
 
248 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  30.17 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  30.89 
 
 
246 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  31.13 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.86 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.21 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  34.15 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  36.59 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  33.77 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  34.91 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  23.9 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  36.59 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  35.85 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  36.59 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  41.67 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  35.77 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  24.59 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.45 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  26.51 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  23.79 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  22.73 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  50 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  23.29 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  35.9 
 
 
345 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  40.98 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
342 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  24.7 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
314 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  35.79 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  32.98 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  40.58 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  22.34 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  26.2 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  25.1 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  29.89 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  28.41 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  37.66 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 
266 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  24.52 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  23.67 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  21.34 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  22.8 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  35.48 
 
 
441 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  27.91 
 
 
357 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 
362 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  31.65 
 
 
404 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  31.91 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  27.05 
 
 
271 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  18.67 
 
 
252 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
301 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
351 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  31.33 
 
 
167 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.58 
 
 
311 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  23.31 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  29.33 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 
307 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  32.81 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  33.33 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  31.82 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>