162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4317 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  44.23 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  43.44 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  37.87 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  36.47 
 
 		 256 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  54.17 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  53.47 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  32.62 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  26.12 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  30.38 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  27 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  27.76 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  34.65 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  34.65 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.91 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.02 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  34.56 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  26.42 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  26.45 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  45.59 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  22.51 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  45.9 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  38.27 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  36.59 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  33.71 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  25.19 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  42.65 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  41.27 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  41.27 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  42.65 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  41.18 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.92 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  42.65 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  23.46 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  40.58 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  30.88 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  30.88 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  23.25 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  33.78 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  22.89 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  38.75 
 
 		 511 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.14 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  34.29 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  36.51 
 
 		 441 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  37.1 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  23.08 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  29.47 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  27.17 
 
 		 387 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  27.17 
 
 		 387 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  27.17 
 
 		 387 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  33.78 
 
 		 469 aa  52  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  21.88 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  32.5 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  28.38 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.78 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  21.92 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  32.47 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  32.47 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  36.71 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 369 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  22.69 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  22.22 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  32.1 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>