225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1813 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  96.75 
 
 		 334 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  89.18 
 
 		 342 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  83.19 
 
 		 339 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 339 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  78.11 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  60.95 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  62.81 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  63.19 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  63.19 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  62.91 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  62.54 
 
 		 336 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  62.54 
 
 		 336 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  57.3 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  52.39 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  77.51 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.04 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  29.68 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  30.03 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  31.09 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.47 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  28.45 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  31.52 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.9 
 
 		 300 aa  99.4  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  28.49 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.1 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  26.48 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 322 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  28.22 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.48 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.17 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.32 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  28.22 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.73 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.22 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  27.03 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  27.03 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  24.46 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.43 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  27.22 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  27.33 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  27.33 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.87 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  27.03 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.17 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  25.76 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  28.75 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.25 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  25.29 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25.44 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.61 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  26.41 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  24.77 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  26.06 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.18 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  26.87 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  32.07 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.97 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.42 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  27.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  27.6 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  27.3 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  27.13 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  45.33 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  27.13 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  25.3 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  23.1 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.35 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.04 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  28.71 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  33.86 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  33.83 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  42.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  42.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  43.16 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  23.5 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.54 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  36.36 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.11 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  20.32 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>