221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1263 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  631  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  63.22 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  66.25 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  29.28 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  26.58 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  27.25 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  28.36 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  27.22 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  27.85 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  27.3 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  24.36 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  26.79 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.62 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.62 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  39.29 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.35 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  31.88 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  39.29 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  46.97 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.75 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.75 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.24 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.17 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  20.83 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.3 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  23.93 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.19 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  48.44 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  48.44 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  48.44 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  23.82 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  22.95 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  37.18 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  21.64 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  42.42 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  42.42 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  31.78 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  26.28 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  42.42 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  42.42 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  42.42 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  42.42 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  42.42 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.91 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  43.55 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  45.31 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  22.8 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  43.75 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  37.97 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  23.84 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  21.94 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  45.31 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  35.29 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  27.78 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  41.27 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  25.22 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  33.87 
 
 		 510 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  36.51 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  21.17 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30.71 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  22.81 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>