172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1708 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  23.35 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  24.6 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  20.74 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  22.83 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  23.11 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  24.24 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  21.37 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  36.05 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  28.14 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  22.38 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  24.6 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  37.5 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  21.65 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  20 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  29.67 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  29.67 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  22.11 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  20.59 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  22.92 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  24.4 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  32.1 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  26.38 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  21.54 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  27.97 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  35.62 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  22.73 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  23.48 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.4 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  26.02 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  35.48 
 
 		 687 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  32.39 
 
 		 448 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  23.66 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  32.5 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.94 
 
 		 340 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  32.48 
 
 		 312 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  32.14 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  26.04 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.98 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.64 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  24.28 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  25.55 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  26.04 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 351 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  30.26 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  30.67 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.82 
 
 		 338 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  30.67 
 
 		 165 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  21.77 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  23.02 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 351 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  21.84 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  32.39 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  25.2 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 352 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  25.42 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25.4 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  26.83 
 
 		 364 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  21.01 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  28.17 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  31.34 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  30.77 
 
 		 409 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  31.17 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  31.17 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30.14 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  25.4 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>