86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  957    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  50.66 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  22.65 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  38.61 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  37.97 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 345 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  35.06 
 
 		 312 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  38.57 
 
 		 191 aa  54.3  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  34.21 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.24 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 246 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.89 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  35.53 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.24 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  30.48 
 
 		 271 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 277 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  33.78 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  50.8  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 284 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  36.11 
 
 		 345 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  29.49 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  34.43 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  35.29 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.29 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 307 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 281 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  35.29 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  37.68 
 
 		 511 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  30.95 
 
 		 285 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  34.29 
 
 		 191 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  33.78 
 
 		 143 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  32.56 
 
 		 289 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.59 
 
 		 263 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  30.26 
 
 		 321 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.59 
 
 		 210 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  33.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  30.99 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  33.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  28.04 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.62 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  32.79 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  24.63 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  35.38 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  27.1 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  32.31 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.21 
 
 		 311 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  32.86 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  38.6 
 
 		 325 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  30.88 
 
 		 251 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 338 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  30.99 
 
 		 323 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 338 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  36.76 
 
 		 293 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>