58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0933 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  90.05 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.55 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  42.65 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  29.03 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 296 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  30.23 
 
 		 338 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 342 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.35 
 
 		 345 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  32.73 
 
 		 266 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  26.37 
 
 		 324 aa  48.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 273 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  32.93 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  34.29 
 
 		 469 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  23.84 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  27.14 
 
 		 331 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  27.14 
 
 		 334 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  28.46 
 
 		 295 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 		 280 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  32.35 
 
 		 291 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 249 aa  44.7  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  25.95 
 
 		 278 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.46 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1153  hypothetical protein  25.79 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.174564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.24 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 329 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  25.75 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.23 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.35 
 
 		 336 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  27.96 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 326 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  24.29 
 
 		 348 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  24.29 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  22.32 
 
 		 364 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 260 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  26.76 
 
 		 367 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  27.12 
 
 		 340 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  30.67 
 
 		 372 aa  41.6  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  24.82 
 
 		 285 aa  42  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 312 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  26.02 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  26 
 
 		 436 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  41.2  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>