125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0955 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  90.05 
 
 		 191 aa  293  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.3 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  30.08 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1153  hypothetical protein  29.79 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.174564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  42.65 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 298 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  28.7 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  27.5 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.24 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  38.57 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  28.57 
 
 		 324 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 		 326 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.85 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 342 aa  52.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  28.21 
 
 		 372 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 130 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 329 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  33.73 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  29.84 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 345 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  32.2 
 
 		 340 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 328 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  23.93 
 
 		 364 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.06 
 
 		 313 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 312 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  35.21 
 
 		 280 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.58 
 
 		 314 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  26.06 
 
 		 404 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  29.13 
 
 		 293 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  33.82 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.24 
 
 		 291 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 260 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  27.05 
 
 		 357 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 241 aa  47.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  27.91 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  25.22 
 
 		 436 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  33.8 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  30.61 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.68 
 
 		 293 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.08 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.59 
 
 		 380 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  27.59 
 
 		 376 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.59 
 
 		 375 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.18 
 
 		 307 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  27.27 
 
 		 399 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  29.58 
 
 		 382 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  32.39 
 
 		 308 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  32.84 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  32.84 
 
 		 304 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  23.89 
 
 		 321 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.37 
 
 		 263 aa  44.7  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  31.03 
 
 		 368 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  30.43 
 
 		 378 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.79 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.37 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 345 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  31.03 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.56 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  34.38 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  28.57 
 
 		 405 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  26.85 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  27.97 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  37.7 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  30.99 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  27.36 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>