208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08820 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  31.09 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  29.37 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  27.11 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  27.5 
 
 		 303 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  27.5 
 
 		 303 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  27.54 
 
 		 303 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  27.46 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  26.26 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25.9 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  27.63 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  26.43 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  28.98 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.14 
 
 		 303 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 234 aa  92  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  25.19 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  21.24 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  24.23 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  37.3 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  31.75 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  26.49 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  23.77 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  46.38 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  21.16 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.45 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  50.75 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  22.01 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  21.03 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  40.23 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  24.18 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  21.85 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  29.51 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  22.85 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  20.53 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  37.68 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  23.35 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  22.45 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  24.62 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  25.46 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  45.59 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.08 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.49 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  20.66 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  26.47 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.42 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.42 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  36.36 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  20.57 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  32.56 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.21 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  21.64 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  26.61 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  36.76 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  40.26 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  19.14 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  29.58 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  40.26 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  19.14 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  37.68 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  29.17 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  26.72 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  23.9 
 
 		 566 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  23.42 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  23.39 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  18.96 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  18.96 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  29.03 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  30.43 
 
 		 404 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  25.81 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.61 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  29.08 
 
 		 398 aa  52.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.17 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>