206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1596 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  38.1 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  34.46 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  45 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  31.06 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  31.06 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  31.06 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  31.06 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  45.33 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  28.12 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  28.12 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  28.21 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  41.33 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  28.75 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  32.28 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  31.3 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.35 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  27.35 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  40.74 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  30.71 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.35 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  43.75 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  43.75 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  41.25 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  25.9 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  32.28 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  26.88 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.5 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  40.62 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  46.27 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  45.31 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  26.25 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  29.08 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  26.25 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.95 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.95 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  42.19 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  25.62 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  43.28 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  27.62 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  37.63 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  26.67 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  33.06 
 
 		 510 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36.71 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  45.76 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  31.4 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  40.26 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  37.97 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  40.54 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  38.96 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  38.36 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  30.3 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  35.53 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 199 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  42.62 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 130 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 130 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  39.71 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  29.7 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  28.05 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  41.54 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  27.33 
 
 		 406 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  26.45 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  42.25 
 
 		 436 aa  52.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  27.14 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  32.14 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>