128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1342 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  30.53 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  37.8 
 
 		 340 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  25.4 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.06 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  34.25 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.25 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  29.01 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  29.01 
 
 		 308 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  38.46 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.62 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  30.37 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  36.11 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.03 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 273 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  29.41 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 285 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  23.62 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  28.24 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 328 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  33.82 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  32.31 
 
 		 347 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  32.31 
 
 		 348 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 277 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  34.18 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 343 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 345 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  26.47 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 319 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.35 
 
 		 407 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 501 aa  47.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 352 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  30.67 
 
 		 325 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  36.36 
 
 		 291 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 342 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  27.16 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.5 
 
 		 291 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  25.71 
 
 		 289 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 351 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  27.91 
 
 		 280 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  30.14 
 
 		 333 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  32.88 
 
 		 271 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  28.03 
 
 		 301 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  24.04 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  27.4 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  31.15 
 
 		 364 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  18.18 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  31.08 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  18.8 
 
 		 326 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  30.26 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 		 511 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  18.8 
 
 		 324 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  28 
 
 		 510 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  27.54 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  28.17 
 
 		 448 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  30 
 
 		 393 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  32.79 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  20.75 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 325 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 267 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.64 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  26.39 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  32.84 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>