181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2434 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  70.55 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  70.55 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  70.55 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  70.23 
 
 
303 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  69.9 
 
 
303 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  69.58 
 
 
303 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  69.26 
 
 
303 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  65.7 
 
 
304 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  67.96 
 
 
308 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  67.31 
 
 
308 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
296 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  38.05 
 
 
297 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  27.04 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  57.5 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  44.53 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  28.88 
 
 
258 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  42.53 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  34.4 
 
 
241 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.18 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  47.95 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  25.55 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  45.95 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  34.62 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  21.09 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  34.15 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  34.38 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  50 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  34.91 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  23.62 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  35.38 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  21.94 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  25.27 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  29.26 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  23.16 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  24.13 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  44.12 
 
 
448 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  38.96 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  38.04 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.99 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  39.73 
 
 
441 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 
345 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  23.37 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  34.21 
 
 
566 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  42.03 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  20.72 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  32.03 
 
 
193 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.42 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  43.75 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  29.31 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  41.18 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.93 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  29.23 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  42.65 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  34.72 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  37.04 
 
 
246 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  25.95 
 
 
436 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  36.62 
 
 
510 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  36.62 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  35.71 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  30.23 
 
 
130 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  29.47 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  29.1 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.73 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  28.76 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  25.74 
 
 
357 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  40 
 
 
278 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  28.42 
 
 
360 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  27.56 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.51 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 
334 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  36.23 
 
 
245 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>