234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1943 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  38.8 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  34.72 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  31.06 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  35.42 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  30.8 
 
 		 287 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  31.33 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  30.47 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  29.48 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  29.69 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  31.47 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  31.84 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.8 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  25.61 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  34.39 
 
 		 304 aa  89  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  25.79 
 
 		 273 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  26.45 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  25.42 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  27.72 
 
 		 289 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  29.34 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  26.98 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  26.45 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  27.88 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  26.98 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  28.23 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  26.35 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  40.48 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  27.84 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.38 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  30.08 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  35.48 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  27.46 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  34.44 
 
 		 566 aa  82.4  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  28.73 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  29.77 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  28.03 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  47.3 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  41.46 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.57 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  32.43 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  25.81 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  48.1 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  27.91 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  24.51 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.11 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.11 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  36 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  34.32 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  43.06 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  43.06 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  43.16 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 328 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  26.62 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.17 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  27.2 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  23.29 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  40.28 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  43.55 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  47.69 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  26.29 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.93 
 
 		 357 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.05 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  42.65 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  46.03 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  39.76 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.4 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  37.76 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  31.37 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  38.67 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.4 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  41.43 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 329 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  34.88 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  33.62 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>