224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2019 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  28.78 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  38.84 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.85 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  41.76 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  52.86 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  38.84 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  23.38 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  25.36 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.35 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.09 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.65 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  24.57 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  31.72 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  42.71 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  33.6 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  47.14 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  28.52 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  45.07 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  29.05 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  32.28 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  23.83 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  25.5 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  23.73 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  33.78 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  39.51 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  32.88 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  29.71 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  37.37 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.51 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  33.08 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  29.51 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  41.1 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  35.71 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  30.17 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  34.78 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.82 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  25.74 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  37.08 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  42.68 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  39.39 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  35.8 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.37 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  34.62 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  34.34 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  34.29 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  34.34 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  34.62 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  34.34 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  30.5 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  34.62 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  34.62 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  34.57 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  24.01 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>