161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0866 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  872    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.88 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  40.23 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  40.85 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  28.34 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  41.67 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  41.1 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.55 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  43.55 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  39.73 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  43.48 
 
 		 303 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  43.48 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  41.1 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  41.1 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  40.58 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  41.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  36.62 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  30.49 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  38.24 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  36.62 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  39.34 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  32.05 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.21 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 234 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  34.85 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.84 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  32.84 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  29.41 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  36.36 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  36.36 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  31.63 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  32.43 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  27.63 
 
 		 243 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  34.25 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 196 aa  54.3  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  36.51 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  36.99 
 
 		 280 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  38.71 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  36.07 
 
 		 293 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  31.11 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  33.8 
 
 		 281 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  33.8 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  33.8 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  35.21 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  35.21 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  34.25 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 287 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  36.99 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  33.82 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.35 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  38.24 
 
 		 314 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  34.25 
 
 		 300 aa  50.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  33.85 
 
 		 266 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  34.85 
 
 		 291 aa  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 130 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  35.59 
 
 		 288 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>