195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3307 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  48.43 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  44.31 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  38.15 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  38.98 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  37.14 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  35.71 
 
 		 565 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  30.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.16 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  27.76 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  21.24 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  28.95 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  22.42 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  22.27 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.5 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.55 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  25.36 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  24 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  23.84 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  23.89 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  22.38 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  23.86 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  23.86 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  25.34 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.11 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  23.99 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  36 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  21.71 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  21.71 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  21.71 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.46 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.46 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  26.89 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  22.81 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  24.25 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  20.85 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  20.85 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  26.16 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  20.49 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  25.37 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  24.6 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  36.29 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.2 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  39.29 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  35.9 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  35.9 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  35.45 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.62 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  36.99 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  35.9 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  35.9 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  35.9 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  35.9 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  36.99 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.62 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  31.75 
 
 		 374 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.05 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  21.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  23.22 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  27.05 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  34.62 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  21.4 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.53 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.97 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.97 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.97 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  23.97 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  35.62 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  22.96 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  29.21 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  34.38 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>