190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2554 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  90.98 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  48.41 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  43.07 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  47.53 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  37.54 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  32.53 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.09 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  25.19 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.77 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  26.15 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  27.67 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  26.06 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  28.08 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.82 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  34.13 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  28.11 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  23.7 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  32.64 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  40 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  24.63 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.18 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  31.71 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  30.71 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  48.57 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  31.5 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  22.18 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  42.05 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  24.33 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  34.68 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  29.19 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.45 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.46 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.25 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  41.38 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  28.28 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 		 301 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 342 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  34.88 
 
 		 374 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  25.34 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.21 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  42.86 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  28.35 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  37.35 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.47 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  23.88 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  38.82 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  28.96 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  44.83 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  24.3 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.36 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.36 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  37.08 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.65 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  29.63 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  38.57 
 
 		 441 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.2 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  23.28 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  42.19 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  37.23 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 130 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 130 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  39.13 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  37.84 
 
 		 142 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  22.99 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  22.76 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  32.94 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  37.84 
 
 		 142 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  32.94 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.58 
 
 		 350 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>