232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0990 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 314 aa  634    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.69 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  24.44 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  23.55 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  23.55 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  23.55 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.44 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  44.71 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  31.88 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  28.12 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  28.53 
 
 		 404 aa  75.9  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.96 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  32.31 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  26 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  32.61 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.88 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.77 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  54.29 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  21.85 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  21.09 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  32.56 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  25.48 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.85 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  44.44 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  27.99 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.21 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.03 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  36.25 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.52 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  35.54 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  32.38 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.23 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.55 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  45.71 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  29.5 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  23.58 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  31.15 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  28.23 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.57 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  24.92 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  40.48 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  40.26 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  25.17 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  32.98 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  26.67 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.84 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.43 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.16 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.16 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  45.9 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.75 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  34.25 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  37.65 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  37.65 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  24.68 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  37.65 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  37.65 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  37.65 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  37.65 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  37.65 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  38.03 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.24 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  36.62 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  38.67 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  32 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>