98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3481 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  26.69 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  41.11 
 
 
687 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  25.68 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  36.51 
 
 
773 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.67 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  25.26 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  23.91 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  38.89 
 
 
266 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  21.56 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.6 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  22.12 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  26.16 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  23.66 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  39.29 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  24.75 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.06 
 
 
407 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  44.29 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  34.44 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
511 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  27.86 
 
 
566 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  22.42 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  26.61 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.16 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  23.61 
 
 
311 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.84 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  21.77 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  22.22 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  23.38 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  24.03 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  24.03 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  32.86 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  29.11 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  22.48 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  23.17 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  23.59 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  32 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  27.1 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  32.39 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  21.93 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  26.62 
 
 
166 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  21.57 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  33.33 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  33.85 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  30.43 
 
 
448 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  25.25 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  22.48 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  32.22 
 
 
289 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
249 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  21.38 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  23.13 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  25.3 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  29.23 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  21.62 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  21.62 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  29.17 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  27.16 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  27.78 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  22.01 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  32.1 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  32.1 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  32.1 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  32.1 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.63 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  32.1 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  32.1 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  32.1 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  32.31 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  27.63 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  29.23 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  27.63 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  23.15 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  23.29 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  29.07 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 
246 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  30.56 
 
 
441 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  32.79 
 
 
243 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0688912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>