130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  772    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  32.61 
 
 		 378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  39.44 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  33.98 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.24 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  44.44 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  32.97 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  32.97 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  29.67 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  36.62 
 
 		 143 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  37.68 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 297 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  34.25 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.87 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  35.06 
 
 		 313 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  34.41 
 
 		 273 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  36.62 
 
 		 142 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  36.23 
 
 		 271 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  32.94 
 
 		 142 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  35.14 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  34.67 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  37.68 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  42.62 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  32.56 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  37.7 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  32.56 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  40.98 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  31.43 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.4 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  33.8 
 
 		 245 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 265 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  31.43 
 
 		 263 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  36.62 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 267 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  29.35 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  28.95 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  28.95 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  28.95 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 273 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.84 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  26 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  34.67 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  39.19 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  39.19 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  31.65 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.89 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  32.22 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  24 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  30.11 
 
 		 308 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.78 
 
 		 300 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  30.11 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 234 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  33.78 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.27 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  32.43 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  38.36 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  37.1 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>