159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1465 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 234 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  29.92 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  29.66 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  29.18 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  26.75 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  26.79 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  22.27 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.37 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  23.95 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  28.88 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  29.22 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  23.68 
 
 		 345 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  24.6 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  25.37 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  39.02 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  24.4 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  39.08 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  25.94 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  36.11 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  28.36 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  20.87 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  25.22 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  21.92 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  32.39 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  49.18 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  21.48 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  39.13 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  23.35 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.81 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.05 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  22.09 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  23.75 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  41.79 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  34.25 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  34.25 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.81 
 
 		 368 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.91 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.81 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.81 
 
 		 345 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  41.56 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.19 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  20.08 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  28.92 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  26.5 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  24.37 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  30.39 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.02 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  26.27 
 
 		 374 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  30.39 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  24.37 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.78 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  22.1 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  28.69 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  34.38 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  34.38 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  25.62 
 
 		 333 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  28.21 
 
 		 393 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  20.87 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  26.09 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  27.52 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.44 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.98 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  26.74 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  32.86 
 
 		 382 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  20.26 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  26.32 
 
 		 566 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  37.88 
 
 		 336 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  26.55 
 
 		 436 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>