141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2608 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  753    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  27.69 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  47.14 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  31.33 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  32.03 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 279 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 296 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  30.69 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  41.1 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  32.23 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  32.03 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  27.07 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  31.25 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  36 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  30.08 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  35.37 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  36 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  40.28 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  37.68 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  31.34 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.44 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  38.36 
 
 		 308 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  34.72 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.35 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  29.06 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  42.65 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  33.71 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  39.44 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  36.99 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  36.99 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  38.24 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  38.24 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  25.6 
 
 		 566 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  38.24 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  31.51 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.8 
 
 		 436 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  26.02 
 
 		 252 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  29.57 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  32.86 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  31.06 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  35.37 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  35.14 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  31.4 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.51 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  31.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  31.51 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  31.51 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  31.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  35.29 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  31.51 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  31.51 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  31.51 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  31.51 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  31.51 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  31.51 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 301 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.62 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  42.19 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  42.19 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 276 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  32.65 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  32.88 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  33.8 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  25.55 
 
 		 166 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  35.38 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  24.79 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>