112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0458 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  323  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04831  hypothetical protein  87.12 
 
 		 164 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  77.91 
 
 		 163 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  71.03 
 
 		 188 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  43.48 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  44.88 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  35.21 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  52.31 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.1 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  31.58 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  31.58 
 
 		 368 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  35.56 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  36.99 
 
 		 319 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  31.94 
 
 		 374 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 351 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  32.37 
 
 		 258 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  26.28 
 
 		 313 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 260 aa  51.2  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  31.46 
 
 		 248 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  31.46 
 
 		 248 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  31.17 
 
 		 398 aa  50.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 345 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  24.81 
 
 		 304 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  32.86 
 
 		 324 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  25.77 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  25.55 
 
 		 372 aa  48.5  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 279 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  25.42 
 
 		 252 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  26.15 
 
 		 308 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  22.48 
 
 		 308 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  24.03 
 
 		 303 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 362 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  27.27 
 
 		 336 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 336 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 319 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 273 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  48.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 360 aa  47.8  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  29.07 
 
 		 340 aa  47.8  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  30.26 
 
 		 314 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  28.75 
 
 		 441 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  35.53 
 
 		 256 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  22.93 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  26.23 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.81 
 
 		 314 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  29.85 
 
 		 367 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36.62 
 
 		 246 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 266 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  21.79 
 
 		 288 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  45.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 339 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 339 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 297 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 280 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  33.82 
 
 		 331 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  44.3  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  26.74 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 328 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  21.53 
 
 		 300 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  26.79 
 
 		 566 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  31.94 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.81 
 
 		 407 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  26.39 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  30.26 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 342 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  19.86 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  22.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 370 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 369 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  32.35 
 
 		 334 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.86 
 
 		 304 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 287 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  28.75 
 
 		 293 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  24.46 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>