89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0624 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  533  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  38.52 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  38.14 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  38.14 
 
 		 165 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  27.56 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  31.3 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  37.35 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  27.2 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.15 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.56 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.35 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.55 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  26.2 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  35.29 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  21.93 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.08 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  32.5 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  29.92 
 
 		 340 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04831  hypothetical protein  28.76 
 
 		 164 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  24.65 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  37.88 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  29.69 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  23.01 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  24.35 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  38.75 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  27.41 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  35.44 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  35.44 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  28.12 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  35.29 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  22.05 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  22.94 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  31.43 
 
 		 294 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  32.35 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  31.17 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  33.82 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  33.82 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  33.82 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  33.82 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  33.82 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  33.82 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  30.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  34.67 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  22.01 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  34.29 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  32.84 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  31.82 
 
 		 441 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  32.84 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  27.38 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  30.88 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  20.14 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 270 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>