25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09801 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  44 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  46.4 
 
 		 306 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.2 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  42.75 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  36.67 
 
 		 177 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  35.78 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  34.86 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  30.56 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  27.61 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  25.17 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  23.24 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  42.19 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  37.68 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  33.77 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  44.07 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  25.73 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 199 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  36.51 
 
 		 236 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 273 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>