25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1615 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  51.03 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.07 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  40.77 
 
 		 128 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.62 
 
 		 177 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  36.3 
 
 		 177 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  23.65 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  23.65 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  37.97 
 
 		 368 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  37.97 
 
 		 368 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  26.92 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  34.38 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  27.82 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  29.47 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  21.74 
 
 		 162 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  35.38 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1093  hypothetical protein  21.62 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  41.27 
 
 		 357 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>