18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15001 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  100 
 
 		 177 aa  343  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  92.09 
 
 		 177 aa  320  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.67 
 
 		 309 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  35.56 
 
 		 306 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  28.02 
 
 		 297 aa  88.6  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  41.27 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  31.01 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  29.61 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  30.43 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1093  hypothetical protein  30.91 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  37.29 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  26.98 
 
 		 256 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  33.9 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  39.58 
 
 		 165 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>