13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11881 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  100 
 
 		 164 aa  311  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  79.27 
 
 		 164 aa  247  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1093  hypothetical protein  75.61 
 
 		 164 aa  223  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  56.41 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  31.82 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  30.43 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.78 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  24.79 
 
 		 297 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.17 
 
 		 309 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  22.3 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  32.88 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  40.91 
 
 		 167 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  32.91 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>