76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04591 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  322  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  56.72 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  56.72 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  51.61 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  57.81 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  58.46 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  52.31 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  56.9 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
272 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
199 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.06 
 
 
296 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
273 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04831  hypothetical protein  35.88 
 
 
164 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  26.06 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.75 
 
 
304 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35 
 
 
284 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  23.65 
 
 
308 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  32.84 
 
 
441 aa  47.8  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
312 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  31.25 
 
 
312 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  31.75 
 
 
308 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
297 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  30.89 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  30.16 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  31.33 
 
 
266 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  32.31 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
287 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 
266 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.43 
 
 
338 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
345 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
319 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
273 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  29.85 
 
 
300 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  29.58 
 
 
311 aa  44.3  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  25.23 
 
 
364 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  31.43 
 
 
511 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 
351 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  29.91 
 
 
256 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 
278 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  40.91 
 
 
164 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  29.51 
 
 
324 aa  41.6  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 
265 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 
342 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
338 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
338 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
334 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.58 
 
 
313 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.15 
 
 
307 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  32.31 
 
 
360 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  32.31 
 
 
336 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.12 
 
 
324 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  32.31 
 
 
336 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  40.68 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  32.79 
 
 
300 aa  40.8  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  40.68 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  40.8  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  27.69 
 
 
367 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 
314 aa  40.8  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  32.31 
 
 
360 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 
326 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  30.67 
 
 
304 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.47 
 
 
293 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  32.31 
 
 
362 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  26.23 
 
 
345 aa  40.8  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>