99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1738 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  26.95 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  38.13 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  26.06 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  25.78 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  46.75 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  32.43 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  32.43 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  37.21 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  31.41 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.11 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.91 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04831  hypothetical protein  33.59 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  40.85 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  32.8 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  23.85 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  23.29 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35.48 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.8 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  20.55 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  36.11 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  24.3 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  24.06 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.53 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  36.05 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  22.57 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  23.55 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  26.36 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.13 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  27.13 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  23.81 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.77 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  40.3 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  29.79 
 
 		 360 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  26.7 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  25.2 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  34.85 
 
 		 441 aa  45.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  25.58 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  24.4 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  33.85 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  35.21 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  33.85 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.36 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.03 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  30.38 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  36.36 
 
 		 448 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  36.51 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  36.23 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  28.79 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  30.23 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  30.23 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  28.72 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  30.23 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.23 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  36.07 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  36.07 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.78 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30.23 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  31.4 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  21.79 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.49 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 342 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  29.58 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>