13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0668 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 177 aa  347  7e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  92.09 
 
 		 177 aa  320  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.2 
 
 		 309 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  35.92 
 
 		 306 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  88.2  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  41.27 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  29.03 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  28.78 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  29.75 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1093  hypothetical protein  29.58 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  33.87 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  37.29 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>