24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1376 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1615  hypothetical protein  51.03 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11051  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00522567  normal  0.438958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15001  helix-turn-helix  28.02 
 
 		 177 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0668  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.93 
 
 		 177 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11891  helix-turn-helix  24.79 
 
 		 164 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11881  helix-turn-helix  24.79 
 
 		 164 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.50952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  31.17 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11721  helix-turn-helix  22.22 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.193067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  33.8 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  24.63 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  35.29 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  35.29 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  22.92 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  38.98 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  26.35 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  32.79 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>