129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2609 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  47.6 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  46.3 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  38.84 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  53.28 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  54.08 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  54.08 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  50.4 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  54.43 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  57.89 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  44.16 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  21.6 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.81 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  34.72 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  25.78 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  24.11 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.3 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.76 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  36.62 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.27 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  24.31 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  38.1 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  38.1 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  26.76 
 
 		 165 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  37.65 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  26.35 
 
 		 165 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  22.46 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.86 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  23.68 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  36.47 
 
 		 448 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  39.71 
 
 		 286 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  39.71 
 
 		 286 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 196 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 289 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  25.55 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  22.51 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  23.1 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  26.18 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.57 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  25.55 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.85 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  23.66 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.64 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  21.9 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  20.88 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  21.9 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  29.86 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  21 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.18 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  41.18 
 
 		 300 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  26.2 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  21.86 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.63 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  27.74 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28.18 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  31.43 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  36.62 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.38 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  29.63 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  28.28 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  34.07 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.01 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  27.01 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  32.93 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.22 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  30.95 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  31.87 
 
 		 448 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.62 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  32.43 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  32.39 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  23.21 
 
 		 393 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.62 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  26.28 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  34.48 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  25.7 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  28.08 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  39.39 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  26.28 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>