107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5020 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  42.57 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  43.77 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  42.07 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  42.07 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  38.65 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  36.2 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  34.04 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.97 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.3 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  47.02 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.13 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  25.3 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  36.28 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  52 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  23.2 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  27.07 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.33 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.44 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  25.36 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  27.73 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  27.73 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  23.01 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  23.14 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  23.62 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  22.16 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.92 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.16 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  21.74 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.91 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  27.79 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  24.93 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  28.48 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  26.96 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  24.05 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  25.77 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.69 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  24.57 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  24.08 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.29 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  20.39 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  20.39 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  22.77 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  23.58 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  22.25 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  27.2 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  23.78 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  25.5 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.13 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  20.93 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  33.78 
 
 		 165 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  23.19 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  24.51 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  24.51 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  33.78 
 
 		 165 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  23.24 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  24.49 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.13 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  24.14 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35.07 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  32 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  31.76 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  23.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  23.03 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  23.99 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  23.48 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  36.84 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  36.84 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  36.84 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  36.84 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  36.84 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  36.84 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  24 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  34.21 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.56 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  39.29 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>