185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06111 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  58.93 
 
 		 288 aa  328  7e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  59.29 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  54.88 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.51 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.54 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.39 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.39 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  26.46 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.52 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.12 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  23.41 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.41 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  26.97 
 
 		 336 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  24.85 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  26.97 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.09 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  23.1 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  25.31 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.3 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  23.8 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.27 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  25.96 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  25.22 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.77 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  26.32 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  28.4 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  29.05 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  24.75 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  29.14 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  21.9 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  23.1 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  29.05 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.87 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  23.21 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  21.77 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  30.83 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.62 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.26 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  24.16 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  30.08 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  24.16 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  41.79 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  30.08 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.39 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.28 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.6 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.02 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  19.77 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  38.1 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  27.51 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  20.62 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  31.29 
 
 		 565 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  39.44 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  22.61 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  30.29 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  41.33 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  32.58 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  39.71 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  39.44 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  41.79 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  41.89 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  36.71 
 
 		 448 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  21.2 
 
 		 341 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  39.71 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  35.23 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.46 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  40.85 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>