104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0734 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 404 aa  783    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  26.36 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.05 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.33 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.3 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.22 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  24.64 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.17 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  24.79 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  24.57 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  25.71 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  26.1 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  23.33 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  24.49 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  23.55 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  24.57 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  25.21 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.82 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  21.74 
 
 		 336 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  31.1 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  22.41 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  22.44 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  25.28 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  31.1 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.51 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  23.31 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  23.3 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  23.86 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  24.5 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  49.21 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  23.74 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  27.2 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  22 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  26.29 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  23.43 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  22.77 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  26.98 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  26.98 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  21.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  21.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  21.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  21.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  21.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  22.29 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  21.71 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.42 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  21.14 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  21.9 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  23.32 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  30.22 
 
 		 299 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  25.41 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  39.71 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  39.71 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  39.71 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  34.21 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.56 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.56 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  44.29 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  30.09 
 
 		 248 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 196 aa  50.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.43 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.96 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  35.53 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.22 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  35.29 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  29.51 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  28.81 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  31.97 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  24.52 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.67 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.67 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  32.63 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  32.63 
 
 		 308 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  33 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  29.17 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  21.41 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>