93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0081 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  47.8 
 
 
318 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  46.26 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  46.42 
 
 
350 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  38.49 
 
 
304 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  37.87 
 
 
309 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  59.18 
 
 
322 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  59.18 
 
 
308 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  48.84 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  58.75 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  28.42 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  43.81 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.81 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  30.49 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  31.4 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  31.4 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  24.48 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  25.24 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  30.33 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  22.95 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  29.07 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  18.56 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  24.76 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  29.92 
 
 
380 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.92 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  29.92 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.45 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.22 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  22.44 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  34.75 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  28.08 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  27.51 
 
 
293 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 
404 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  35.82 
 
 
341 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  25.62 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.16 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  20 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  23.47 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  21.26 
 
 
393 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.35 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  26.77 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  26.77 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  22.78 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.77 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  26.77 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  22.26 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  25.07 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  24.3 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.33 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  23.03 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  28 
 
 
448 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  34 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  23.48 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  23.53 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  31.94 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  31.94 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  22.14 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  24.74 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  28.74 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.91 
 
 
252 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
339 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
339 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  24.91 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  22.22 
 
 
330 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  23.89 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  24.48 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  40.58 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  19.93 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  24.48 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  39.73 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  23.19 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  32.84 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  32.84 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
196 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  38.24 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  32.84 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  24.19 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.56 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  29.23 
 
 
163 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  24.11 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.248516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>