163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2991 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  715    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  96.95 
 
 		 361 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  98.6 
 
 		 356 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  96.95 
 
 		 361 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  60.31 
 
 		 380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  60.95 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  66.39 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  62.3 
 
 		 374 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  60.37 
 
 		 376 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  45.67 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  41.27 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  41.28 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  45.1 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  42.33 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  41.81 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  40.48 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  32.55 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  30.41 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  30.46 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  29.86 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  29.55 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  32.75 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  27.73 
 
 		 296 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  28.21 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  30.68 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  30 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  29.59 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  29.53 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  28.21 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  28.16 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  29.65 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  30.43 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  27.38 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.83 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  31.01 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  25.13 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.43 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  28.02 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  26.78 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  25.36 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  23.89 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  24.13 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  24.23 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.3 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  23.24 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  39.37 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  42.39 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  39.24 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.52 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  40.43 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  26.19 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  30.47 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  33.7 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  23.59 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  23.59 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  33.65 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  26.12 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.2 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.2 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  27.54 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 130 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  36 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  31.08 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  35.37 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>