174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2366 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  695    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  40.53 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  40.8 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  39.63 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  40.7 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  44.21 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  40.69 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  41.57 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  43.23 
 
 		 361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  40.34 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  40.34 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  45.29 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  43.29 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  43.7 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  38.42 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  34.3 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  31.13 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  31.58 
 
 		 296 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  28.9 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  33.04 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  34.13 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  32.46 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  31.52 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  32.46 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  31.87 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  31.3 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  30 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  30.99 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  30.55 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  30.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  30.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  30.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  30.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  30.26 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  27.48 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  30.26 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  30.53 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  29.34 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  28.07 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  28.65 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  26.82 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  24.92 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  28.7 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  27.25 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  26.89 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.41 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  51.32 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  51.32 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.44 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  26.44 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  44.74 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  43 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  44.87 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.89 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  37.8 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.1 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  40.48 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  30.3 
 
 		 210 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  30.3 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  39.24 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  36.26 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  33.04 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  37.18 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  34.48 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  34.48 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  24.08 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  28.83 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  34.94 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  36.62 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  35.44 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  22.4 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>