135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3010 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  100 
 
 
336 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  77.55 
 
 
336 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.248516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  76.38 
 
 
337 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  76.38 
 
 
337 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  76.74 
 
 
337 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  76.38 
 
 
337 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  76.38 
 
 
337 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  76.38 
 
 
337 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  76.09 
 
 
337 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  76.92 
 
 
334 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  76.09 
 
 
337 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  76.92 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  76.92 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  75.58 
 
 
336 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  74.43 
 
 
334 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  67.76 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  58.13 
 
 
345 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  55.32 
 
 
363 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  54.07 
 
 
368 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  55.04 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  56.94 
 
 
334 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  54.57 
 
 
323 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  55.49 
 
 
332 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  36.02 
 
 
393 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  33.43 
 
 
323 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  33.23 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  32.94 
 
 
321 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  32.71 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  32.27 
 
 
336 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  27.5 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  25.98 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.49 
 
 
374 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.22 
 
 
380 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  27.32 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  26.63 
 
 
364 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  28.21 
 
 
356 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  25.75 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  29.03 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  27.11 
 
 
356 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  27.49 
 
 
325 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  27.45 
 
 
361 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  27.45 
 
 
361 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  25.49 
 
 
345 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 
351 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  28.61 
 
 
340 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  27.16 
 
 
318 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  27.89 
 
 
361 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.15 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  25.95 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 
329 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.2 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  29.01 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.85 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.85 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  27.78 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  27.64 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  50 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  47.3 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  47.3 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.84 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.59 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.53 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  24.5 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.2 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  38.16 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  26.93 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  26.93 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.44 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  24.84 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.57 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.6 
 
 
311 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  37.65 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  38.82 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  26.72 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  26.72 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  37.97 
 
 
448 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  37.18 
 
 
360 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  37.18 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  37.18 
 
 
387 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  37.18 
 
 
387 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  37.18 
 
 
387 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  37.18 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  37.18 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>