72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1167 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  749    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  28.45 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  29.26 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  25.99 
 
 		 334 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  25.07 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.35 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  26.9 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  24.3 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  28.92 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28.92 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  46.27 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  41.43 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.28 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  44.78 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  44.78 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.41 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.18 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  23.92 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  24.81 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  37.14 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  25.19 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  24.18 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  45.9 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  42.62 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.03 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  41.79 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  40.48 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  31.93 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  33.75 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  32.37 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  36.84 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.36 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30.12 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  39.51 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  34.72 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  34.72 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.12 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  30.77 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  31.08 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  31.08 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  31.08 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.49 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  29.33 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  35.38 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  29.69 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  29.49 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  32.84 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>