174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0079 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  33.71 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.2 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.2 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  36.84 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  37.69 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  36.09 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  35.34 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  36.15 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  36.15 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  35.34 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  34.59 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  35.34 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  35.38 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.79 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  30.35 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 260 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  23.62 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  45.9 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.06 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  26.47 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  35.04 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  40.24 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  37.63 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  36.52 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  42.86 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  28 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  26.16 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  35.37 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  33.86 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  40.91 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  32.03 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  42.03 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  45.9 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  47.54 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  37.08 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  34.25 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  27.05 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  45.21 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  41.67 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  29.74 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  38.24 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  39.34 
 
 		 441 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.68 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  40.98 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  40.28 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  40.28 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  40.28 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  40.28 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.5 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  39.39 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  36.49 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.76 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  40.28 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  40.28 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  40.28 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  32 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  27.5 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  38.16 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.5 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  32.12 
 
 		 510 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  33.98 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  38.24 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  42.03 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  24.2 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.54 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  36.84 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  29.75 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>