88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2318 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1082    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  32.55 
 
 		 256 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  58.9 
 
 		 273 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  51.22 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  56.16 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  26.27 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  30.07 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  38.16 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  36.05 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  37.88 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.66 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  38.96 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  29.74 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  35.71 
 
 		 393 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  25.5 
 
 		 246 aa  57  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  36.36 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  29.25 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  36.36 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  31.29 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  31.29 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.74 
 
 		 246 aa  53.9  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  34.25 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  34.25 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  35.29 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  33.8 
 
 		 361 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 298 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  31.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  31.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 325 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  39.71 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  28.75 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 297 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  36.62 
 
 		 291 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  38.96 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  38.81 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  36.23 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 342 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  27.87 
 
 		 330 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  29.58 
 
 		 340 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 296 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 130 aa  47  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  32.39 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  19.67 
 
 		 245 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3239  heat shock protein DnaJ domain protein  31.71 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  22.06 
 
 		 325 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  30.67 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.36 
 
 		 284 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  23.97 
 
 		 267 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  40.68 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  39.68 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  39.68 
 
 		 292 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  32.86 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  32.79 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  20.74 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  27.35 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 291 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.71 
 
 		 304 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  31.88 
 
 		 303 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  34.85 
 
 		 288 aa  43.9  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  34.85 
 
 		 288 aa  43.9  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 267 aa  43.5  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>